Metropolis’un canlı ve karmaşık sokaklarında, Lois Lane ve Jimmy Olson, şehri kaplayan gizemle yüzleşir. Adalet Birliği’nin beklenmedik ve esrarengiz kayboluşunun ardından, şehirde bir kaos hüküm sürmektedir. Bu gizemli durumu çözmek için Adalet Salonu’na doğru yönelirler, ancak araştırmaları bir hayaletin ansızın ortaya çıkmasıyla sekteye uğrar ve peşlerine düşer. Korku dolu anlarda, çaresizlik içinde, Lois ve Jimmy, yardım için en güvenilir ekibe, yani Mystery Incorporated’a başvurur. Ekip, aceleyle Metropolis’e doğru yola çıkar. Ancak yolda, şehrin Justice League’in yokluğunda süper kötüler tarafından ele geçirildiğini öğrenirler. Bu karanlık gelişme karşısında Lois ve Jimmy’nin tek sığınakları Daily Planet olur. Sonunda güvenli limanlarına varan ikili, durumu açıklamak için Mystery Incorporated ile buluşur. Birlikte, Adalet Salonu’nda derinlemesine bir araştırmaya koyulurlar. Ancak beklenmedik bir sürprizle karşılaşırlar: Lex Luthor, Mercy Graves ve hatta Luthor’un sadık köpeği Rex. Şimdi, bu karmaşık olayları çözmek için, Mystery Incorporated ve Lois ile Jimmy, Krypto adında güçlü bir süper köpek ile güçlerini birleştirmek zorundadırlar. Adalet Birliği’nin kayboluşunun perdesini aralamak için zorlu bir mücadeleye atılırlar.