1982 yılında, uzayın derinliklerinden gelen son bir grup uzaylı, Dünya’da kendilerine yeni bir yuva aramak için yola çıkar. Güney Afrika’nın tenha bir köşesine yerleşen bu varlıklar, insan gözünden uzak bir yaşam sürmeyi umut ederler. Ancak bu umutları, MNU adlı dev bir şirketin dikkatini çekmeleriyle suya düşer. Şirket, uzaylıların ileri teknolojik bilgisini ele geçirerek büyük kazançlar sağlamak ister ve bu amaçla onları District 9 adı verilen kapalı bir bölgeye hapseder. Planlarını hayata geçirmek için uzaylıların DNA’sını ele geçirmeye çalışırken, MNU’nun sıradan bir çalışanı olan Wikus van der Merwe, beklenmedik bir şekilde bir virüse maruz kalır. Virüs, onu yavaş yavaş bir uzaylıya dönüştürmeye başlar ve Merwe, hem insanlardan hem de uzaylılardan kaçmak zorunda kalır. District 9’a sığınan Merwe, burada hem kendini korumak hem de insanlığın ve uzaylıların kaderini değiştirecek bir savaşın ortasında bulur kendini. Artık tek hedefi, hayatta kalmak ve yeni bir başlangıç yapmaktır.